تفریق مولکولی آسپرژیلوس های جدا شده از هوای تهران با استفاده از تکنیک rapd-pcr

پایان نامه
چکیده

در مطالعه حاضر، تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنی گونه های آسپرژیلوس جداسازی شده از هوای تهران با استفاده از روش مولکولی تکثیر تصادفی dna چندشکلی (rapd-pcr)مورد بررسی قرار گرفت. 38 ایزوله از 12 گونه آسپرژیلوس، شامل 11 ایزوله از آسپرژیلوس نایجر، 7 ایزوله از آسپرژیلوس فلاووس، 4 ایزوله از آسپرژیلوس ژاپونیکوس، 5 ایزوله از آسپرژیلوس توبینجنسیس، 4 ایزوله از آسپرژیلوس اوخراسئوس و 1 ایزوله از هر یک از گونه های آسپرژیلوس نیدولانس، آسپرژیلوس آمستلودامی، آسپرژیلوس اوریزا، آسپرژیلوس ورسیکالر، آسپرژیلوس ترئوس، آسپرژیلوس فلاویپس و آسپرژیلوس فومیگاتوس، بر روی محیط سابورو دکستروز آگار کشت داده شدند و سپس استخراج dna انجام گردید ¬و¬¬ جهت تکثیر قطعات ژنی با استفاده از تکنیک rapd-pcr، از 11 آغازگر استفاده گردید. 7 آغازگر pm1،opw-04، opw-05، p160، p54، p10، opa14 قادر به تولید قطعات بیشتری بوده و از آغازگرهای opa20 opa17،opa10، opa117 پاسخ مناسبی دریافت نشد. با استفاده از 7 پرایمر تصادفی، 1052 قطعه ژنی تکثیرگردید. آغازگرpm1 بیشترین قطعه و opa14 کمترین قطعه را ایجاد نمودند و میانگین قطعات ایجاد شده از 150 تا 2500 جفت باز بوده است. قطعات ژنی تولید شده توسط هر آغازگر شامل: pm1 (181 قطعه)، opw04 (176 قطعه)، p10 (156قطعه)، p160 (147قطعه)، opw05 (145قطعه)، p54 (142قطعه)، opa14 (105 قطعه) بود. به منظور تجزیه و تحلیل داده های حاصل از واکنش rapd-pcr از نرم افزار upgma استفاده گردید و نتایج دندروگرام حاصل از ترکیب 7 آغازگر تشکیل 8 خوشه اصلی برای 12 گونه آسپرژیلوس شامل 38 زیرگونه را نشان داد. ایزوله های آسپرژیلوس نایجر با درصد ¬تشابه 41 درصد، ایزوله های آسپرژیلوس ژاپونیکوس 87 درصد، ایزوله های آسپرژیلوس فلاووس 31 درصد، ایزوله های آسپرژیلوس توبینجنسیس 18 درصد و ایزوله های آسپرژیلوس اوخراسئوس 37 درصد، هرکدام دریک خوشه و آسپرژیلوس نیدولانس، آسپرژیلوس اوریزا و آسپرژیلوس ورسیکالر در یک خوشه جداگانه دارای یک جد مشترک بودند. نتایج نشان دادکه گونه های مورد نظر از الگوی متفاوتی برخوردار بوده و با بررسی الگوی فیلوژنی گونه ها و سوشهای مربوطه، به تنوع ژنتیکی بین و درون گونه ای با استفاده از تکنیک rapd پی برده شد و rapd-pcrبه عنوان تکنیکی سریع، حساس و تجدید پذیر جهت تشخیص گونه های آسپرژیلوس کارایی بالایی داشته و می توان از آن جهت دست یابی به اطلاعات جامع برای برنامه ریزیهای موثر جهت کنترل عفونت های ناشی از آسپرژیلوس ها استفاده نمود.

منابع مشابه

بررسی مولکولی گونه های بیماریزای آسپرژیلوس جدا شده زخم پای افراد دیابتی با استفاده از روش Nested PCR

Background and Aim:  PCR has high sensitivity and specificity for the determination offungal DNA. It is also useful for rapid identification of the most common species of Aspergillus. The purpose of this study was to compare culture method with nested PCR method to determine Aspergillesion in diabetic foot patient in Imam Khomeini Hospital, Tehran. Material and Methods: Sixty-five case...

متن کامل

بررسی مولکولی گونه های بیماریزای آسپرژیلوس جدا شده زخم پای افراد دیابتی با استفاده از روش nested pcr

زمینه و هدف: روش pcr حساسیت و ویژگی بالایی را جهت  تعیین dna قارچی و شناسایی سریع اغلب گونه های شایع کلینیکی آسپرژیلوس را ارائه میدهد. هدف از این مطالعه مقایسه کشت با روش nestedpcr برای تعیین آسپرژیلوزیس از زخم پای بیماران دیابتی مراجعه کننده به بیمارستان امام خمینی تهران بود.  روش: 65 نمونه زخم های مشکوک به آسپرزیلوزیس موجود در زخم پای دیابتی تحت شرایط کشت و pcr قرار گرفتند. ایزوله های آسپرژیل...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی لاکتوباسیل های جدا شده از محصولات لبنی سنتی ایران توسط RAPD PCR

Normal 0 false false false EN-US X-NONE AR-SA /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Table Normal" mso-tstyle-rowband-size:0 mso-tstyle-colband-size:0 mso-style-noshow:yes mso-style-pri...

متن کامل

بررسی پلی‌مورفیسم ژنومی کاندیدا آلبیکنس جدا شده از واژینیت به روش RAPD-PCR

Abstract Introduction: Candida albicans are human selective symbiosis, mainly located in the gastrointestinal tract. This group of fungi is pathogenic where host resistance reduces to local or systemic infection. Bacteria are the most common cause of vaginitis, but candida albicans are the second leading cause of such infections. Candida albicans are responsible for 70-90% of the fungal infect...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023